Нужно в типовые основания документов добавить параметр "связанный заказ" для дебетового оборота, а в программе доступно только акт/накладная или счет фактура. Ерунда какая то получается - расчеты ведутся позаказно, а привязать можно только акт, которого на момент поступления денег по предоплате еще не существует.